ELIXIR vienā no gada nozīmīgākajiem bioinformātikas un skaitļošanas bioloģijas pasākumiem – ECCB 2026 Ženēvā

No 2026. gada 31. augusta līdz 4. septembrim Ženēvā, Šveicē, norisinājās 25. Eiropas Skaitļošanas bioloģijas konference (angl. the European Conference on Computational Biology, ECCB 2026), kuru organizēja Šveices Bioinformātikas institūts (SIB). ECCB ir viens no Eiropas vadošajiem starptautiskajiem pasākumiem skaitļošanas bioloģijas jomā, kurā zinātnieki, pētniecības infrastruktūru nodrošinātāji, nozares līderi un politikas veidotāji apmainās zināšanām, demonstrē inovācijas un veido nozares nākotni. Trīs dienu zinātniskajai programmai, kas norisinājās no 31. augusta līdz 2. septembrim, 3. septembrī sekoja darbnīcas, apmācības un simpoziji, savukārt 4. septembrī pasākumu noslēdza Kopienu diena (Communities Day).

ECCB 2026 zinātnisko programmu veidoja astoņi galvenie virzieni: ievērojamu zinātnieku plenārlekcijas; genomika, epigenomika un genoma rediģēšana; transkriptomika un gēnu regulācija; proteīnu izpēte un strukturālā bioloģija; sistēmbioloģija, multiomikas datu integrācija un modelēšana; bioloģiskā daudzveidība, ilgtspēja un vides bioinformātika; īpašais virziens; kā arī ELIXIR veltītais virziens.

Plenārlekciju daļā izskanēja priekšlasījumi par seno cilvēku migrāciju, šūnu tipu veidošanos un imūnreakciju izpēti, izmantojot lielapjoma datus. Genomikas virziens aptvēra sekvenču alignēšanu un ģenētisko variantu identificēšanu, genoma valodas modeļus, vēža genomiku, slimību riska modelēšanu un privātumu aizsargājošus sintētiskos genomus. Proteīnu izpētes un strukturālās bioloģijas virzienā uzmanība tika pievērsta struktūru un mijiedarbību prognozēšanai, proteomikas datu kvalitātes uzlabošanai, ģeneratīvam proteīnu, antivielu un peptīdu dizainam, molekulārajai dokēšanai un patogēno variantu novērtēšanai. Sistēmbioloģijas virzienā multiomikas, vienas šūnas līmeņa un telpisko datu integrācija tika savienota ar tīklu un metabolisma modelēšanu, pacientiem pielāgotiem biomarķieru modeļiem, zināšanu grafiem un histopatoloģijas attēlu analīzi.

Transkriptomikas un gēnu regulācijas virziens aptvēra telpiskās transkriptomikas metodes, RNS splaisingu, hromatīna cilpu un transkripcijas faktoru darbības modelēšanu, vienas šūnas līmeņa laikrindu salīdzinošo novērtēšanu un šūnu  stāvokļa trajektoriju analīzi. Bioloģiskās daudzveidības virzienā tika pētīti cilvēka un vides mikrobiomi, metagenomika, koraļļu rifu bioloģiskā daudzveidība un vīrusu genomika, kā arī ilgtspējīga bioloģisko datu infrastruktūra. Tajā aplūkoja arī plašus kohortu pētījumus par zarnu mikrobiotas īpatnību saistību ar ilgtermiņa veselības iznākumiem. Īpašajā virzienā uzmanība tika pievērsta industrijai un inovācijām, jauniem skaitļošanas bioloģijas pētniecības virzieniem, sieviešu pieredzei nozarē, uzņēmējdarbībai, karjeras attīstībai, kā arī bioloģiskās daudzveidības un klimata jautājumiem. 

ELIXIR — Eiropas dzīvības zinātņu infrastruktūra bioloģiskās informācijas jomā — ir viens no galvenajiem ECCB konferences atbalstītājiem un ilggadējiem dalībniekiem. ELIXIR veltīto plenārsesiju „Iepazīstinām ar ELIXIR programmu” papildināja desmit sesiju ELIXIR tematiskā programma, kurā tika aplūkots plašs aktuālo jautājumu loks: genoma variantu identificēšana un analīze federētā vidē, izmantojot Globālās genomikas un veselības alianses (Global Alliance for Genomics and Health, GA4GH) standartus, ELIXIR pētniecības programmatūras ekosistēma un mākslīgā intelekta atbalstīta sistēmbioloģija, kas balstīta atrodamības, piekļūstamības, sadarbspējas un atkārtotas lietojamības (angl. Findability, Accessibility, Interoperability and Reusability, FAIR) principos. Programmā uzmanība tika pievērsta arī cilvēku datiem un pētniecības rīkiem, augu zinātnei un sistēmbioloģijai, datu un programmatūras sadarbspējai, apmācībai bioloģiskās daudzveidības jomā, kā arī datos balstītām inovācijām veselības aprūpē.

ECCB 2026 piedalījās arī divi Latvijas pārstāvji no Rīgas Stradiņa universitātes (RSU), kuri prezentēja stenda referātu par FAIR principiem atbilstošām skaitļošanas darbplūsmām, „Ceļā uz FAIR principiem atbilstošiem un privātumu aizsargājošiem sintētiskiem veselības datiem: reproducējama darbplūsma to ģenerēšanai un novērtēšanai”.

Kā jau iepriekš ziņots, 2025. gada 1. jūnijā Rīgas Stradiņa universitāte (RSU) uzsāka projektu „RSU dalība Apvārsnis Eiropa programmā” (projekta Nr. 1.1.1.5/3/25/I/014). Projekts īsteno vienu no jaunajiem Latvijas Nacionālās partnerības un rīcības plāniem Eiropas Pētniecības infrastruktūru stratēģiskā foruma (ESFRI) un Eiropas pētniecības infrastruktūras konsorcija (ERIC) ietvarā — Latvijas integrāciju ELIXIR. RSU pārstāvju dalība ESBK 2026 šo nacionālo virzību tieši sasaistīja ar Eiropas skaitļošanas bioloģijas kopienu. Latvijai turpinot darbu, lai nākotnē izveidotu savu nacionālo ELIXIR mezglu, konference parādīja Eiropas zinātniskās sadarbības mērogu un daudzveidību, kurā Latvija tiecas iesaistīties arvien ciešāk.