Latvija ELIXIR All Hands 2026 sanāksmē iesaistās Eiropas-līmeņa diskusijā par bioinformātikas un veselības datu nākotni
18. jūnijs, 2026. gads
No 8. jūnija līdz 10. jūnijam Lionas pilsētā Francijā jau 12. reizi pēc kārtas norisinājās ikgadējā Eiropas dzīvības zinātņu infrastruktūras bioloģiskajai informācijai konsorcija (ELIXIR) All Hands 2026 sanāksme. Šī sanāksme ir viens no centrālajiem ELIXIR kopienas notikumiem, kas pulcē pārstāvjus no visiem ELIXIR Mezgliem, kā arī sadarbības partnerus no industrijas un akadēmiskajām institūcijām visā Eiropā. Tā ir nozīmīga platforma, kurā apspriež aktuālos sasniegumus, kā arī ieskicē nākotnes plānus un stiprina kopienas sinerģiju visās tās darbības jomās.
ELIXIR All Hands 2026 sanāksmes programma skaidri parāda, ka dzīvības zinātņu pētniecība arvien ciešāk savijas ar datu pārvaldību, uzticamu skaitļošanas infrastruktūru, mākslīgā intelekta risinājumiem un starptautiski saskaņotiem standartiem. Trīs dienu garumā plenārsesijās, darbnīcās un mini simpozijos tika apspriesta FAIR principu praktiskā ieviešana, pētniecības datu pārvaldība, programmatūras kvalitāte un ilgtspēja, federētā skaitļošana, veselības datu izmantošana pētniecībā, izglītības kapacitātes stiprināšana, kā arī ELIXIR pakalpojumu ilgtermiņa attīstība.
Veselības dati bija viens no redzamākajiem All Hands 2026 tematiem. Jo īpaši, darbnīca „Veselības datu standartu lietojums Eiropā: no OMOP līdz GA4GH” pievērsās tam, kā Eiropā lieto klīnisko un veselības datu standartus, tostarp OMOP kopējo datu modeli un Globālās genomikas un veselības alianses (GA4GH) standartus, piemēram, Beacon, Uzdevumu izpildes servisu (TES)/Darba plūsmas izpildes servisu (WES), Phenopackets un Passports/AAI digitālās identitātes standartu. Šī diskusija bija būtiska, jo genomikas un molekulārie dati jau izmanto salīdzinoši nobriedušus standartus, savukārt, klīnisko datu vide daudzviet joprojām ir sadrumstalota, sarežģīta un datus ir grūti sekundāri izmantot pētniecībā.
Latvijai ļoti nozīmīga sesija bija arī darbseminārs „Veselības datu savienošana visā Eiropā: kā mēs varam palīdzēt cits citam?”, kurā ELIXIR mezgli dalījās pieredzē par veselības datu infrastruktūru, sensitīvu datu pārvaldību, Vispārīgās datu aizsardzības regulas (GDPR) prasību ievērošanu, drošām analītikas vidēm, un apsprieda sadarbības iespējas saistībā ar Eiropas veselības datu telpu (EHDS) un ELIXIR iniciatīvām cilvēku datu un translacionālās pētniecības jomā. Šajā sesijā Latviju pārstāvēja Rīgas Stradiņa universitātes tenūrprofesore Baiba Vilne, kura nākotnē ieņems topošā Latvijas ELIXIR mezgla vadītāja lomu; viņa bija viena no runātājiem un sniedza īsprezentāciju par valstī veidojošos veselības un omikas datu ekosistēmu, tās esošajiem resursiem un galvenajiem izaicinājumiem.
Latvijas prezentācijā tika uzsvērts, ka valsts vēl veido savu ELIXIR mezgla ekosistēmu, taču tai jau ir vairāki resursi, kurus iespējams sasaistīt ar plašāku Eiropas infrastruktūru. To vidū ir Latvijas iedzīvotāju genoma datubāze un populācijas genoma references resursu attīstība, dalība iniciatīvā 1+ Miljons Genomu, vairākas ar biobankām saistītas aktivitātes; Precīzijas medicīnas centrs pediatrijā, kas apvieno genomiku, bioinformātiku, diagnostiku, biobankas un klīniskos pētījumus. Latvijas pētniecības vide arvien vairāk izmanto arī augstas veiktspējas skaitļošanu, mākslīgo intelektu/ mašīnmācīšanos, FAIR principiem atbilstošas darbplūsmas, sintētiskos datus un privātumu aizsargājošas analītikas pieejas.
Tajā pašā laikā Latvija šobrīd saskaras ar vairākiem praktiskiem izaicinājumiem, kas ir kopīgi daudzām Eiropas valstīm. Lai veselības un omikas datus varētu droši un efektīvi izmantot pētniecībā, jāstiprina pārvaldība un savietojamība starp veselības aprūpes un pētniecības informācijas sistēmām, jāuzlabo datu kvalitāte un strukturētība, jāpaplašina kopīgu standartu — tostarp, OMOP CDM, HL7 FHIR, SNOMED CT, LOINC un GA4GH — ieviešana, kā arī jāattīsta droša nacionālā vide sensitīvu datu otrreizējai izmantošanai, federētai analīzei un liela mēroga omikas datu apstrādei.
All Hands 2026 programmā veselības datu jautājumi bija cieši saistīti ar plašāku digitālās pētniecības infrastruktūras attīstību. Mini simpozijs par ELIXIR Skaitļošanas Platformu aplūkoja, kā federētie skaitļošanas pakalpojumi var tikt sasaistīti ar Eiropas Atvērtās zinātnes mākoņa (EOSC) federāciju, EuroHPC un Eiropas mākslīgā intelekta (AI) fabrikām, nodrošinot pētniekiem piekļuvi izkliedētām un uzticamām skaitļošanas iespējām. Savukārt darbnīca par Modeļu konteksta protokola (MCP) serveriem aplūkoja, kā ELIXIR pakalpojumus padarīt pieejamākus lielo valodas modeļu (LLM) darbinātiem rīkiem, vienlaikus saglabājot kvalitāti, uzticamību un ilgtspēju.
Darbnīca par lielajiem valodas modeļiem dzīvības zinātņu izglītībā aplūkoja gan mākslīgā intelekta sniegtās iespējas mācību materiālu veidošanā, gan riskus, kas saistīti ar pārmērīgu paļaušanos uz automatizētiem risinājumiem.
Sanāksmes noslēgumā uzmanība tiKA pievērsta ELIXIR augstas ietekmes projektiem sensitīvu un augstvērtīgu datu jomā, infrastruktūras vidusposma izvērtējumam un nākamās, 2029.–2033. gada zinātniskās programmas plānošanai. Šie jautājumi ir būtiski arī Latvijai, jo tie nosaka, kā Eiropas līmenī tiks attīstīta uzticama, savietojama un ilgtspējīga dzīvības zinātņu datu infrastruktūra.
2025. gada 1. jūnijā Rīgas Stradiņa universitāte uzsāka projektu „RSU dalība Apvārsnis Eiropa programmā” (projekta Nr. 1.1.1.5/3/25/I/014), kura ietvaros tiek īstenots viens no jaunajiem Latvijas nacionālajiem partnerības un rīcības plāniem Eiropas Stratēģiskā foruma pētniecības infrastruktūrām (ESFRI) un Eiropas Pētniecības infrastruktūras konsorcija (ERIC) ietvarā — Latvijas integrācija ELIXIR. Dalība All Hands sanāksmē palīdz Latvijai ātrāk pārņemt pārbaudītus risinājumus, stiprināt datu pārvaldības un bioinformātikas prasmes un pilnvērtīgi iekļauties Eiropas veselības un dzīvības zinātņu datu telpā.
